崇仁听后大怒：“混账！我身为庆尚道右兵使，我的军令必须服从，违令者当立即斩首，立刻打开城门，否则将以叛乱大罪论处！”城门回答依然如故，坚持不开晋州大门，柳崇仁怒不可遏：“国难当头应当上下同心，军民同力，你等居然公然违背军令，如何能守住晋州？金时敏何在，叫他立刻出来见我！”

城门答到金时敏公务繁忙，不能相见，柳崇仁屡次叫骂无果，愤恨交加，便领所部调转马头，反扑夺回昌原，日军见朝鲜败兵归来再战，皆十分惊讶随即便转入防御，日军铁炮遍布城头，朝鲜军难以靠近，死伤渐渐增多，木村重兹眼见机会来临便领本部三千人出城破敌，朝鲜军军覆没，柳崇仁中弹倒地被木村重兹刺死。长谷川秀一命令打扫战场，超度柳崇仁亡灵并派小股部队探查晋州情报。

时金时敏早已在晋州筹备日久，囤积粮草，扩充兵员，赶制守城器械及石块木料等物，布置火炮引入飞击震天雷，加强守兵守城、射箭、近身战等方面的训练，并派人联络各路义军加入晋州城防。此前投降朝鲜的日将冈本越后守已被朝鲜王赐名为金忠善为朝鲜效力，根据金忠善提供的日军火绳枪构造信息，金时敏招募能工巧匠加紧仿制，已成功仿制一百七十余梃火绳枪，备下五百余斤硝石。金时敏研究火绳枪用法之后便挑选精兵分配枪支，每日严格训练射击直至深夜。

昆阳县监李光若向金时敏问道：“为何要让城中一半百姓都换上军服活动呢？”金时敏答道：“我军兵力总共仅有三千八百名，虽早已严令任何人不得随意出入晋州但百密一疏，也难保倭寇密探不会潜入城中，因此我便虚张声势以防万一，且百姓对倭寇深恶痛绝，早有从军之意，他日倭寇袭来百姓们也将挺身而出，身穿军服更易使敌有所顾忌，且各路义军皆已联络，随时可在晋州城外投入战斗。我已命庆尚道义军和罗道义军在城外十里之内隐蔽埋伏，分别于第二日、第三日击敌侧后。但愿此战能守得晋州平安。”

随后金时敏询问李光若将士今日训练情况，李光若一一作答之后金时敏说道：“晋州南据江水，西有悬崖，北有护城河，地形上对我有利，但倭寇兵多势强，若不依靠军民同心想要守住晋州实为万难。即便如此也必须拼尽力，不惜性命，否则罗道及部百姓都将面临灭顶之灾！”

十月三日午后，金时敏得报日军应将于明日攻至晋州，金时敏急令军备战，安置检查防御设施，并联络各义军首领依计行事。城中军官向百姓号召共守晋州，百姓深受鼓舞，誓与晋州共存亡。

十月四日，日军前部抵达晋州，晋州城外金时敏已命人在众多拒马阵之间遍布草人身裹军服作张弓射箭姿态，这些稻草人制作十分细致，从远处观望难分真假，日军前部远望晋州城外敌军已严阵以待便立刻就地射击，缓缓前进。金时敏见状也令己方士卒呐喊助威，鸣炮助阵，日军一时间被朝鲜的声势迷惑，铁炮射击不断但进展十分缓慢，片刻之后晋州城外的朝鲜军依然屹立不倒，日军惊讶不已，再度接近才惊觉不过草人扎堆。

日军大怒立即攻城，晋州城箭如雨下，金时敏将一百七十余名精兵手持火绳枪仿日军队列依托城墙三段射击循环不断，旁设三十门火炮发射飞击震天雷爆破散片群伤日军，日军突遭火绳枪射击，心中惊愕，加之飞击震天雷打乱了日军队列，两军各依掩护对射许久，日军失去先机因而伤亡惨重，身在大本营的长谷川秀一、细川忠兴、木村重兹三人听闻朝鲜竟然持有众多火绳枪及新型火炮，为稳妥起见便下令前部撤回，停止进攻军待令。

次日日军集中一万兵力再攻晋州，大股日军推动防御设施以尽量避挡朝鲜火力，中部日军有组织进行方位铁炮射击循环，与朝鲜火力形成相持，在日军逼近晋州近二百步时日军主力冒死突击，在日军铁炮掩护下搭建云梯攀登城楼，朝鲜军近处扔砸石料，持斧锯梯以阻击攀登城楼的日军，并继续以弓箭、火炮及火绳枪射杀，为固守城门不失，金时敏更特意强调优先射杀携带焙烙玉的日兵，城中百姓也纷纷承担运送兵器弹药，救治伤员的事务，晋州朝鲜军日夜训练，战力战心都大为增强，竟与日军战至午后，这令两军都未曾想到。

日军兵员数量占优终于大批攀上城楼与朝鲜军大战，金时敏令火绳枪手退至城内，号召军民攻守晋州，数千百姓身穿军服协同官军在晋州城楼与日军展开血战，战至几近黄昏，日军陆续攀登，郭再佑依照军令领庆尚道义军一千二百人绕道日军背后发起突袭，日军遭两面夹击，心生慌乱，撤出晋州反冲郭再佑所部，郭再佑见状领军遁入山中不与日军纠缠，日军也不恋战，为避免再遭伏击而撤回本营。

细川忠兴见日军不听军令自行撤退且阵亡两千，责令领队主将剖腹自尽。木村重兹建议道：“可见晋州城已早有防备，远非昌原之战可比，我们也不能再在大本营等待消息，应亲赴战场指挥作战，我愿亲领前队拿下城门，斩下金时敏首级。”长谷川秀一则说：“不可鲁莽，朝鲜军拥有铁炮，十分危险。这铁炮构造朝鲜竟也能制作，应该是加藤清正部下冈本越后守投降朝鲜以后所为，这个小人竟然如此卖力。”细川忠兴对此仍不以为意：“即便朝鲜